Micro-organismes pathogènes dans les aliments, généralement les bactéries, champignons, parasites, protozoaires et virus. Le top dix agents pathogènes sont : Salmonella ; Staphylococcus Aureus ; Campylobacter jejuni ; Yersinia enerocolitica ; Listeria monocytogenes ; Vibro cholerae non-01 ; Vibrio Parahemolyticus ; Bacillus cereus ; Escherichia coli - entéropathogène ; et Shigella. Bon nombre de ces agents pathogènes se trouvent dans la viande contaminée, volaille, œufs en coquille, les produits laitiers et fruits de mer.